Keroro, một người lính ngoài hành tinh đến từ Hành tinh Keron, đặt chân đến Trái Đất trong một nhiệm vụ xâm lược nhưng bị hai anh em Fuyuki và Natsumi Hinata phát hiện và bắt giữ. Bị lực lượng Keron chủ lực bỏ rơi và mắc kẹt trên chính hành tinh mà mình được giao nhiệm vụ chinh phục, Keroro cuối cùng phải sống cùng gia đình Hinata và kết bạn với Fuyuki, một cậu bé yêu thích những điều huyền bí. Dù cuộc sống thường nhật trên Trái Đất liên tục cản trở kế hoạch, Keroro vẫn không có ý định từ bỏ tham vọng chinh phục hành tinh này.